柯南和小五郎等拉著大隊，來到位於太平洋中的美麗小島“神海島”渡假。這座島嶼自古已有流傳，大概有關沉沒於海底的古代遺跡“海底宮殿”，及300年前兩名女海盜遺留下來

因為一塊布丁，野原新之助（矢島晶子 配音）和妹妹向日葵（こおろぎさとみ 配音）激烈爭吵，身為哥哥他自然受到爸爸廣誌（藤原啓治 配音）和媽媽美伢（ならはしみき 配

隆（清水宏次朗 配音）和肯（羽賀研二 配音）是年輕的武道家，畢生的理想就是追求更強健的體魄和更強大的力量，為了磨煉技藝，兩人結伴而行開始了周遊世界的旅程，隻為了

鈴木園子的叔叔次郎吉不甘心失敗，決定再次向怪盜基德發出挑戰。這位壞脾氣的大叔斥巨資製造了巨型的飛船貝爾·雪利二世號，並以鑲嵌有名貴寶石“天空的貴婦人”的戒指作賭

堪稱動畫史上的最強對決到來！傳奇大盜魯邦三世（栗田貫一 配音）和他的戰友次元大介（小林清誌 配音）、石川五衛門（浪川大輔 配音）來到東京，以怪盜基德之名挑戰日本